大三，我一门课重修(或者补考)过了，成绩比原来高了许多，申请美国研究生的话，那现在GPA怎么算？

看你这个成绩在成绩单上出现的形式了。很多学校是完全覆盖了原先的成绩，那样最好，按新的算。如果不是这样，那尽量问教务处的阿姨能不能打成绩单的时候踢掉原来的成绩。总之，改GPA从改成绩单入手。当然，不是让你自己改。